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Le projet PHAG-ONE reçoit 2,85 M€ pour développer des virus capables d’éradiquer des bactéries résistantes aux antibiotiques

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Crédit : Pixabay

Article publié sur le site La Veille Acteurs de santé le 02 septembre 2021

Les Hospices Civils de Lyon annoncent le lancement du projet PHAG-ONE qui fait partie des 11 projets retenus
dans le cadre de l’appel à projets « Antibiorésistance : comprendre, innover, agir » piloté par l’Agence Nationale
de Recherche (ANR). Ce programme prioritaire de recherche a été lancé par le gouvernement, sous l’égide du
Secrétariat Général pour l’Investissement et l’ANR, dans le cadre des Programmes d’Investissement d’Avenir.

Comme en virologie avec le SARS-CoV2, la communauté médicale fait actuellement face à la diffusion rapide à
l’échelle mondiale de bactéries qui présentent, en plus de leur virulence, une multi-résistance aux antibiotiques.
Ce phénomène touche la quasi-totalité des grandes familles de pathogènes. En cas d’infection avec ce type de
bactérie, il n’est pas exceptionnel de se retrouver face à des impasses de traitement, avec des patients pour
lesquels aucune antibiothérapie n’est active.

La recherche d’alternatives thérapeutiques dans le domaine des antibactériens constitue donc un enjeu majeur
de santé publique et a été identifiée comme une priorité, aussi bien au niveau national, qu’international. Dans la
continuité du plan d’action mondial pour combattre la résistance aux antimicrobiens adopté par l’OMS en 2015 et
de la publication en novembre 2016, de la feuille de route interministérielle pour la maîtrise de l’antibiorésistance
en France, le gouvernement a décidé de mettre en place un programme prioritaire de recherche (PPR) sur
l’antibiorésistance, doté de 40 M€ sur dix ans. L’objectif de cet appel à projets est de stimuler, promouvoir et
accompagner l’émergence d’innovations diagnostiques, préventives et thérapeutiques et d’aboutir à un meilleur
usage des antibiotiques.

A ce titre, les HCL ont obtenu un financement de 2,85 M€ pour le projet PHAG-ONE dédié à la phagothérapie,
traitement qui utilise des virus, appelés bactériophages, capables de s’attaquer spécifiquement aux bactéries et
de les détruire avec une totale innocuité pour les cellules humaines.

LA NAISSANCE DU PROJET PHAGEinLYON

Découverts à Paris il y a 100 ans par Félix d’Hérelle, les phages sont absents de la pharmacopée européenne et
ont été délaissés en raison de l’avènement des antibiotiques, jugés plus faciles d’utilisation et plus efficaces.
Néanmoins, de plus en plus de patients présentent des infections liées à des bactéries multi-résistantes ; pour
certains, plus aucun antibiotique n’est actif.

Au sein des Hospices Civils de Lyon, le Centre de Référence des Infections Ostéo-Articulaires complexes (CRIOAc
Lyon) a fait ce constat alarmant sur des infections de prothèses de genou et de hanche. Même en l’absence
d’antibiorésistance, ces infections particulièrement difficiles à contrôler peuvent devenir chroniques malgré les
traitements antibiotiques, avec de très graves répercussions sur la qualité de vie des patients : invalidité partielle
ou totale, perte d’autonomie, perte de lien social et de repères sociétaux, amputation du membre atteint voire
décès des suites d’une septicémie.

Ces problématiques se retrouvant dans de nombreuses autres infections, une équipe multidisciplinaire lyonnaise s’est fixée comme objectif de répondre à ce qui tend à devenir une question majeure de santé publique en proposant une alternative aux antibiotiques : LA PHAGOTHÉRAPIE via le programme PHAGEinLYON et aujourd’hui au travers du projet PHAG-ONE.

DEVELOPPER DES VIRUS POUR COMBATTRE LES BACTERIES : LE PROGRAMME PHAGEinLYON

Porté depuis 2017 à l’hôpital de la Croix-Rousse par le Pr Frédéric LAURENT (microbiologiste et Chef de service de
Bactériologie au sein de l’Institut des Agents Infectieux) et le Pr Tristan FERRY (infectiologue et Chef de service
adjoint du service des Maladies Infectieuses et Tropicales), le programme PHAGEinLYON s’est donnée pour objectif
depuis 4 ans de développer en France l’accès à la phagothérapie.

En amont du projet PHAG-ONE, ce programme pilote et innovant, sans équivalent en France, a d’abord bénéficié
d’un fonds d’amorçage de la Fondation HCL, grâce au soutien de nombreux mécènes régionaux. Les avancées
réalisées au sein des HCL ont permis à ce jour de traiter 26 patients uniquement dans un cadre compassionnel
sous la supervision de l’ANSM avec les rares phages disponibles en France, d’initier l’isolement et la
caractérisation de nouveaux phages dans l’environnement et d’en tester l’activité.

Désormais, l’ambition du projet ANR PHAG-ONE est de passer à la vitesse supérieure en réalisant au sein des HCL
l’isolement, la production, la purification, le conditionnement et les contrôles de qualité de phages
thérapeutiques académiques actifs sur 3 espèces (Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis et
Escherichia coli) et remplissant toutes les exigences règlementaires des tutelles et autorités de santé pour une
utilisation chez l’humain.

Les phages thérapeutiques produits, seront ensuite utilisés pour traiter les infections à bactéries multi-résistantes aux antibiotiques, dans un cadre compassionnel et dans le cadre d’essais cliniques. Le projet piloté par les Hospices Civils de Lyon, en lien avec l’Université Claude Bernard Lyon 1 et le Centre International de Recherche en Infectiologie, associe plusieurs institutions au-delà de la métropole lyonnaise : le CEA de Grenoble, des équipes Inserm et CNRS de Montpellier, Paris-Saclay, Versailles-Saint Quentin et Bordeaux.

LES OBJECTIFS DU PROJET PHAG-ONE

– Exploiter la capacité naturelle des virus bactériophages à détruire des bactéries pour apporter une
solution innovante de traitement aux patients en échec thérapeutique.
– Assurer la recherche dans l’environnement puis l’isolement, la production et la purification de phages
thérapeutiques ciblant les espèces bactériennes les plus fréquemment impliquées dans les infections
résistantes aux antibiotiques (notamment le groupe ESKAPE défini par l’OMS).
– Réaliser le conditionnement et l’ensemble des contrôles de qualité requis pour répondre aux exigences
des autorités de santé dans le cadre d’une utilisation chez l’humain.
– Mener des études de cohortes et des essais cliniques visant à optimiser l’utilisation et l’efficacité des
phages afin de contrôler, voire d’éradiquer ces infections, et in fine améliorer la qualité de vie et les
chances de survie des patients.
– Créer à terme, à Lyon, un Etablissement Français du Phage capable de fournir l’ensemble des hôpitaux
français en bactériophages pour traiter les patients en impasse thérapeutique.

Ce projet bénéficiera au sein des HCL des expertises microbiologiques, technologiques, pharmacologiques
pharmaceutiques, et cliniques d’équipes hospitalo-universitaires expérimentées et reconnues dans les
domaines de la prise en charge clinique, des phages et de la production de médicaments. Comme l’a démontré
récemment la rapide mise en place, par la plateforme FRI-PHARM implantée à la Pharmacie de l’hôpital Edouard
Herriot, d’une production académique de curares pour faire face à la pénurie pendant la crise sanitaire liée à la
COVID-19, les HCL disposent d’une maîtrise de la conception, du développement et de la fabrication de traitements
innovants.

L’originalité du projet PHAG-ONE est son caractère intégré au sein d’une seule et même institution hospitalière,
mais aussi sa nature académique, utilisant des structures déjà existantes permettant d’envisager une mise à
disposition de phages à des coûts maitrisés et la création d’une plateforme nationale de production de phages
thérapeutiques. Au-delà, des patients atteints d’infections osseuses pris en charges dans le CRIOAc de Lyon mais
aussi dans l’ensemble des 8 CRIOAc en France, le projet PHAG-ONE ouvre une nouvelle aire des traitements antiinfectieux avec des utilisations possibles, à termes, dans d’autres indications pour l’ensemble de la communauté
médicale française.

REUNION DE LANCEMENT LE 8 SEPTEMBRE

La réunion de lancement du projet PHAG-ONE aura lieu le 8 septembre 2021 de 9h30 à 12h00 à l’hôpital de la
Croix-Rousse, en présence des partenaires institutionnels et des équipes scientifiques.

Le Pr Frédéric LAURENT se tient à votre disposition pour vous apporter des informations complémentaires et vous
rencontrez si vous le souhaitez.

CONTACT: presse@chu-lyon.fr Marion MOUGET, 04 72 40 70 88.

Retrouvez le communiqué de presse des Hospices civils de Lyon ici