Scientifique : |
SUPPLY Philip |
Adresse : |
/ www.ciil.fr |
Domaine d'intervention : |
Antibiotiques et thérapies alternatives, Echantillonnage - détection et diagnostic, Souches bactériennes
Alternatives thérapeutiques, Antibiotiques et antibiothérapie, Bordetella, Clinique, Evolution et phylogenie, Génetique et génomique, Infections respiratoires, Mécanismes de résistance, Mycobactéries |
Unité : |
Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) |
Intitulé d'équipe : |
Recherche en Mycobacteria et Bordetelles |
Responsable :
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DUBUISSON Jean |
Type de structure : |
Académique |
Affiliation : |
INSERM 1019 CNRS 9017 Univ Lille Nord de France Institut Pasteur de Lille CHU Lille |
Région : |
Hauts-de-France |
Ville : |
Lille |
Autre contact : |
JOONNEKINDT Cathy |
Descriptif : |
Nous utilisons des approches de WGS pour étudier les lignées de souches de tuberculose (TB) à succès épidémiologique élevé ou faible dans le monde entier. Nous avons identifié des lignées exceptionnelles d'embranchements anciens (Nat Genet, 2013; Nat Comm, 2020), et reconstitué l'émergence de clones épidémiques multirésistants (MDR) en Eurasie (Nat Genet, 2015). Sur base de 10000 génomes analysés avec le consortium CRyPTIC (Lancet Inf Dis, 2015, NEJM, 2018), j'ai développé avec Genoscreen un nouveau diagnostic « culture-free » par NGS ciblé, appelé Deeplex Myc-TB, prédisant la résistance à 13 antituberculeux (Eur Resp J, 2020), déjà utilisé par l'OMS pour la surveillance. Nous avons ainsi identifié un épisode épidémique de TB MDR en Afrique du Sud non détecté par les tests standards (Lancet Inf Dis, 2018). |
Fiche scientifique / structure