Scientist: |
SUPPLY Philip |
Address: |
/ www.ciil.fr |
Area of intervention: |
Antibiotics and alternative therapies, Sampling - detection and diagnosis, Bacterial strains
Therapeutic alternatives, Antibiotics and antibiotic therapy, Bordetella, Clinic, Evolution and phylogeny, Genetics and genomics, Respiratory infections, Resistance mechanisms, Mycobacteria |
Unity; |
Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) |
Team name: |
Recherche en Mycobacteria et Bordetelles |
Responsible:
|
DUBUISSON Jean |
Type of structure: |
Academic |
Affiliation: |
INSERM 1019 CNRS 9017 Univ Lille Nord de France Institut Pasteur de Lille CHU Lille |
Region: |
Hauts-de-France |
City: |
Lille |
Other contact: |
JOONNEKINDT Cathy |
Description: |
Nous utilisons des approches de WGS pour étudier les lignées de souches de tuberculose (TB) à succès épidémiologique élevé ou faible dans le monde entier. Nous avons identifié des lignées exceptionnelles d'embranchements anciens (Nat Genet, 2013; Nat Comm, 2020), et reconstitué l'émergence de clones épidémiques multirésistants (MDR) en Eurasie (Nat Genet, 2015). Sur base de 10000 génomes analysés avec le consortium CRyPTIC (Lancet Inf Dis, 2015, NEJM, 2018), j'ai développé avec Genoscreen un nouveau diagnostic « culture-free » par NGS ciblé, appelé Deeplex Myc-TB, prédisant la résistance à 13 antituberculeux (Eur Resp J, 2020), déjà utilisé par l'OMS pour la surveillance. Nous avons ainsi identifié un épisode épidémique de TB MDR en Afrique du Sud non détecté par les tests standards (Lancet Inf Dis, 2018). |
Scientific file / structure