{"id":14963,"date":"2021-07-30T11:20:01","date_gmt":"2021-07-30T10:20:01","guid":{"rendered":"https:\/\/ppr-antibioresistance.inserm.fr\/projects-actions-supported\/action-1-results-of-the-call-for-projects-antibiotic-resistance-understand-innovate-act-11-projects-selected\/"},"modified":"2025-04-11T11:25:39","modified_gmt":"2025-04-11T10:25:39","slug":"action-1-results-of-the-call-for-projects-antibiotic-resistance-understand-innovate-act-11-projects-selected","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/ppr-antibioresistance.inserm.fr\/en\/projects-actions-supported\/action-1-results-of-the-call-for-projects-antibiotic-resistance-understand-innovate-act-11-projects-selected\/","title":{"rendered":"Action 1 – Results of the call for projects “Antibiotic resistance: understand, innovate, act” : 11 projects selected"},"content":{"rendered":"\n

11 projects were selected<\/strong> from around 70 submissions (i.e. a success rate of almost 16%), and received grants of between \u20ac1 and \u20ac3 million.<\/p>\n\n\n\n

Each project addresses one or more of the 4 challenges defined below<\/strong>. The objective of stimulating and supporting the emergence of diagnostic, preventive and therapeutic innovations has thus been achieved (see maps):<\/p>\n\n\n\n

Challenge 1<\/strong>) Dynamics and control of the emergence, transmission and dissemination of antibiotic resistance<\/p>\n\n\n\n

Challenge 2<\/strong>) Optimizing antibiotic use in human and veterinary medicine<\/p>\n\n\n\n

Challenge 3<\/strong>) Individual, ethnological and sociological, economic, political and cultural determinants of antibiotic resistance<\/p>\n\n\n\n

Challenge 4<\/strong>) Therapeutic innovation<\/p>\n\n\n\n

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Mapping projects and actions<\/h2>\n\n\n\n

<\/span> Click on a project location to find out more.<\/em><\/p>\n<\/div>\n\n\n\n

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See the list of projects<\/a><\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n
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List of projects and actions<\/h2>\n<\/div>\n\n\n\n
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Back to cartography<\/a><\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\r\n\r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n \r\n
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\r\n \r\n ANORUTI <\/span>\r\n\r\n \r\n Analysis of NOn-Response to antibiotics in vivo<\/i>: application to Escherichia coli<\/i> Urinary Tract Infection <\/span>\r\n\r\n \r\n Analyse de la non r\u00e9ponse aux antibiotiques in vivo<\/i> : application \u00e0 l'infection urinaire \u00e0 Escherichia coli<\/i> <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Bruno Fantin <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Inserm UMR 1137, Universit\u00e9 de Paris IAME <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

Institut Pasteur<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n See the project summary (+) <\/a>\r\n <\/div>\r\n\r\n
\r\n \r\n Challenge: 2) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 48 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Les \u00e9checs aux traitements des infections urinaires \u00e9tant encore trop fr\u00e9quents, le projet ANORUTI se propose d\u2019am\u00e9liorer la compr\u00e9hension de ces \u00e9checs in vivo<\/em> et de fournir des solutions de diagnostic avec une meilleure pr\u00e9cision de pr\u00e9diction. L\u2019objectif est de d\u00e9velopper in vitro<\/em> des plateformes exp\u00e9rimentales de bior\u00e9acteurs et un mod\u00e8le pharmacocin\u00e9tique \u00e0 deux compartiments\u00a0 \u00a0pour \u00e9valuer la croissance et les capacit\u00e9s de survie des bact\u00e9ries dans diff\u00e9rentes conditions afin d\u2019identifier des souches ayant des comportements diff\u00e9rents lorsqu\u2019elles sont analys\u00e9es dans des conditions standard de mesure de la CMI et dans des conditions exp\u00e9rimentales imitant des environnements plus r\u00e9alistes de l\u2019infection urinaire. Seront examin\u00e9s l\u2019impact du pH, de la disponibilit\u00e9 du fer et de la r\u00e9ponse immunitaire de l\u2019h\u00f4te sur la sensibilit\u00e9 aux antibiotiques, la tol\u00e9rance aux antibiotiques, la persistance et la formation d\u2019un biofilm ainsi que les conditions qui pourraient conduire \u00e0 la non r\u00e9ponse au traitement. Ces exp\u00e9riences seront conduites avec des antibiotiques\u00a0 utilis\u00e9s seuls ou en association pour soigner les infections urinaires et une collection importante et diversifi\u00e9e de souches cliniques et g\u00e9n\u00e9tiquement d\u00e9termin\u00e9es. Des exp\u00e9riences in vivo<\/em> seront r\u00e9alis\u00e9es chez la souris pour identifier l\u2019ensemble des environnements in vitro<\/em> \u00e0 prendre en compte, et pour valider les pr\u00e9dictions et observations faites in vitro<\/em>.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n DREAM <\/span>\r\n\r\n \r\n Dynamics of REsistance to Antibiotics within the human gut, Microbiota: combining diet informed population cohort and quantitative in vitro gut studies <\/span>\r\n\r\n \r\n Dynamique de la r\u00e9sistance aux antibiotiques au niveau de l\u2019intestin humain, microbiote : combinaison d\u2019une cohorte de population dont les habitudes alimentaires sont renseign\u00e9es et d\u2019\u00e9tudes quantitatives in vitro sur l\u2019intestin <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Olivier Tenaillon <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Inserm UMR1137, IAME, Universit\u00e9 Paris, Universit\u00e9 Paris Nord <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

Inserm U1016
\nUniversit\u00e9 Sorbonne Paris Nord, CEA – Institut de biologie Fran\u00e7ois-Jacob, Genoscope<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n See the project summary (+) <\/a>\r\n <\/div>\r\n\r\n
\r\n \r\n Challenge: 2) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 72 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Ce projet se propose de r\u00e9pondre \u00e0 une question cl\u00e9\u00a0: \u00e9lucider si le microbiote lui-m\u00eame peut moduler l\u2019impact de traitements \u00e0 base d\u2019antibiotiques et contribuer \u00e0 l\u2019\u00e9mergence de la r\u00e9sistance aux antibiotiques. Pour \u00e9tayer cette hypoth\u00e8se, le consortium se propose d\u2019analyser la r\u00e9sistance aux antibiotiques via<\/em> un mod\u00e8le exp\u00e9rimental de tube digestif (minigut) combin\u00e9 \u00e0 une cohorte finement caract\u00e9ris\u00e9e en termes d\u2019alimentation, la cohorte NutriNet-Sant\u00e9, et ceci avec la souche bact\u00e9rienne mod\u00e8le\u00a0: Escherichia coli<\/em> comme sentinelle d\u2019\u00e9volution de l\u2019antibior\u00e9sistance. Bri\u00e8vement les f\u00e8ces de 100 personnes, s\u00e9lectionn\u00e9es en fonction de leurs habitudes alimentaires, seront caract\u00e9ris\u00e9es par des approches de m\u00e9tag\u00e9nomique et introduites dans les miniguts en pr\u00e9sence d\u2019antibiotiques, de souches bact\u00e9riennes sensibles et r\u00e9sistances aux antibiotiques y compris de souches reportrices du stress ou de l\u2019\u00e9tat m\u00e9tabolique des bact\u00e9ries. Les donn\u00e9es obtenues seront valid\u00e9es par des observations sur 2\u00a0400 personnes avec des r\u00e9gimes alimentaires vari\u00e9s et des exp\u00e9riences in vivo<\/em> et instruiront des mod\u00e8les m\u00e9canistiques ou ph\u00e9nom\u00e9nologiques de l\u2019\u00e9volution de l\u2019antibior\u00e9sistance intra h\u00f4te. \u00e0 terme, ces travaux conduiront \u00e0 identifier des esp\u00e8ces, des microbiotes et\/ou les r\u00e9gimes alimentaires permettant un contr\u00f4le simple de la r\u00e9sistance aux antibiotiques au niveau populationnel.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n DYASPEO <\/span>\r\n\r\n \r\n Dynamics of AMR spread, persistence and evolution between humans, animals and their environment <\/span>\r\n\r\n \r\n Dynamique de la propagation, de la persistance et de l'\u00e9volution de l\u2019AMR entre les humains, les animaux et leur environnement <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Jean-Yves Madec <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Anses EPA <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

\u00c9cole nationale v\u00e9t\u00e9rinaire d’Alfort ;
\nAssistance Publique-H\u00f4pitaux de Paris ;
\nInserm ;
\nInstitut Pasteur, Centre hospitalier universitaire de Clermont-Ferrand ;
\nCNRS<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 1) <\/span><\/strong>\r\n , 3) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 72 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Ce projet se propose de r\u00e9pondre \u00e0 la question qui est pr\u00e9occupante et peu document\u00e9e de la transmission de l\u2019antibior\u00e9sistance (AMR) des animaux de compagnie \u00e0 l\u2019humain en regroupant des comp\u00e9tences uniques en m\u00e9decine humaine et v\u00e9t\u00e9rinaire, en \u00e9tudes cliniques et \u00e9pid\u00e9miologiques, en g\u00e9n\u00e9tique mol\u00e9culaire, \u00e9cologie, g\u00e9nomique des populations et approches fonctionnelles, par des mod\u00e8les in vitro<\/em> et in vivo<\/em>, ainsi que par des analyses informatiques et en sciences sociales. La strat\u00e9gie est de mener une \u00e9tude \u00e9pid\u00e9miologique de 2 ans sur le transport intestinal des r\u00e9sistances aux c\u00e9phalosporines \u00e0 spectre \u00e9tendu (ESC-E) et aux carbap\u00e9n\u00e8mes (CP-E) chez 500 chiens et membres de la maison (HM) avant, pendant et apr\u00e8s l’hospitalisation des chiens. \u00e0 partir des donn\u00e9es recueillies, seront test\u00e9es des hypoth\u00e8ses sur les \u00e9v\u00e9nements de transfert des clones et plasmides au sein et entre les chiens et HM, sur les loci<\/em> de transmission \u00e0 l’h\u00f4te, sur la persistance intestinale des r\u00e9sistances, et sur les voies d’\u00e9volution intra h\u00f4te de ces r\u00e9sistances. L\u2019ensemble sera valid\u00e9 sur des mod\u00e8les cellulaires et in vivo<\/em> et compl\u00e9t\u00e9 par des analyses sur les relations chien\/humain d\u2019un point de vue sociologique. Ces donn\u00e9es int\u00e9gr\u00e9es dans des mod\u00e8les math\u00e9matiques permettront de d\u00e9chiffrer les facteurs de risque d’acquisition de l’ESC-E\/CP-E par l\u2019humain \u00e0 partir de chiens et d\u2019argumenter pour une gestion efficace des risques associ\u00e9s \u00e0 l\u2019exposition de la communaut\u00e9 humaine \u00e0 l\u2019AMR provenant d’animaux de compagnie, qui pourront \u00eatre pris en compte et traduits \u00e0 \u00e9chelle europ\u00e9enne.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n MicroFlu4AMR <\/span>\r\n\r\n \r\n Characterization and high-throughput screening of bacterial communities in the soil: mechanisms of antibiotic resistance and discovery of new antibiotics <\/span>\r\n\r\n \r\n Caract\u00e9risation et criblage par haut d\u00e9bit des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes dans le sol : m\u00e9canismes de la r\u00e9sistance aux antibiotiques et d\u00e9couverte de nouveaux antibiotique <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Andrew Griffiths <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n \u00c9cole sup\u00e9rieure de physique et chimie industrielle de Paris (ESPCI Paris) EPA <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

Universit\u00e9 Bourgogne Franche-Comt\u00e9 ;
\nINRAE Jouy-en-Josas ;\u00a0DEINOVE<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 1) <\/span><\/strong>\r\n , 4) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 48 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Le sol est un formidable r\u00e9servoir de biodiversit\u00e9 microbienne et les antibiotiques existants sont principalement des m\u00e9tabolites secondaires produits par les microorganismes du sol. Partant de ce constat, le projet MicroFlu4AMR articul\u00e9 autour de 4 axes se propose\u00a0: d\u2019\u00e9tudier la diversit\u00e9 fonctionnelle (g\u00e8nes et voies m\u00e9taboliques) des communaut\u00e9s microbiennes du sol impliqu\u00e9es dans la production d\u2019antibiotiques et les r\u00e9sistomes correspondants, de d\u00e9velopper une meilleure compr\u00e9hension des processus \u00e9cologiques et \u00e9volutifs dans les communaut\u00e9s du sol impliqu\u00e9es dans la production d’antibiotiques, et par cons\u00e9quent, \u00e0 leurs r\u00e9sistomes associ\u00e9s, d\u2019\u00e9lucider le r\u00f4le et les m\u00e9canismes du transfert horizontal et vertical de g\u00e8nes dans l’\u00e9volution et la diffusion des antibiotiques et de la r\u00e9sistance aux antibiotiques, et de d\u00e9couvrir de nouvelles classes naturelles d\u2019antibiotiques qui r\u00e9duisent le risque d\u2019\u00e9mergence de r\u00e9sistomes adapt\u00e9s. \u00c0 cette fin, des \u00e9chantillons de sol, s\u00e9lectionn\u00e9s pour couvrir la plus grande diversit\u00e9 microbienne possible, seront analys\u00e9s en s\u2019appuyant sur des approches m\u00e9tag\u00e9nomiques cibl\u00e9es et globales et de criblage ph\u00e9notypique et g\u00e9notypique innovant \u00e0 tr\u00e8s haut d\u00e9bit via<\/em> la plateforme microfluidique \u00e0 base de gouttelettes qui permet l\u2019analyse de microorganismes individuels coupl\u00e9e \u00e0 la production d\u2019antibiotiques d\u00e9tect\u00e9e \u00e0 l\u2019aide de bact\u00e9ries poss\u00e9dant des g\u00e8nes rapporteurs sp\u00e9cifiques. L\u2019ensemble permet un tri des gouttelettes activ\u00e9es par fluorescence \u00e0 des taux allant jusqu\u2019\u00e0 1\u00a0000\u00a0par seconde, et le criblage d\u2019environ 1 million de microorganismes par heure. En parall\u00e8le, un syst\u00e8me permettant le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome entier de milliers de bact\u00e9ries \u2013cultivables et non cultivables\u2013 tri\u00e9es est en cours de mise au point et permettra d\u2019identifier directement des groupes de g\u00e8nes biosynth\u00e9tiques de nouveaux compos\u00e9s antibiotiques ou comprenant des m\u00e9canismes de r\u00e9sistance aux antibiotiques. Ces travaux donneront un aper\u00e7u sans pr\u00e9c\u00e9dent de la diversit\u00e9 et de l\u2019interaction des m\u00e9canismes de r\u00e9sistance aux antibiotiques et contribueront \u00e0 la d\u00e9couverte de nouveaux antibiotiques et m\u00e9canismes de r\u00e9sistance.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n Mustart <\/span>\r\n\r\n \r\n Multiparametric Strategies against Antibiotic Resistance in Tuberculosis <\/span>\r\n\r\n \r\n Strat\u00e9gies multiparam\u00e9triques contre la r\u00e9sistance aux antibiotiques de la tuberculose <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Alain Baulard <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Institut Pasteur de Lille, IPL Autre Fondation de recherche reconnue d'utilit\u00e9 publique <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

CNRS _ D\u00e9l\u00e9gation Occitanie Ouest – Institut de pharmacologie et de biologie structurale ;
\nSorbonne Universit\u00e9 ;
\nInstitut Pasteur de Lille – U1177 ;
\nInstitut Pasteur ;
\nInstitut national des sciences appliqu\u00e9es de Toulouse ;
\nCNRS_ D\u00e9l\u00e9gation Occitanie Ouest – LMGM ;
\nCEA ;
\nHospices civils de Lyon<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 2) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 48 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

La r\u00e9duction de l\u2019incidence mondiale de la tuberculose (TB) observ\u00e9e chaque ann\u00e9e est trop faible pour compenser l\u2019augmentation inqui\u00e9tante de la multir\u00e9sistance aux antituberculeux (TB-MR) et il est urgent de disposer de combinaisons de nouvelles classes d’antibiotiques qui ciblent les mycobact\u00e9ries dans leurs diff\u00e9rentes niches. Le projet Mustart, regroupant sept puissantes \u00e9quipes de recherche sp\u00e9cialis\u00e9es dans la tuberculose (dont deux en milieu hospitalier) ainsi que deux partenaires d\u2019autres domaines apportant des approches m\u00e9thodologiques nouvelles, ambitionne de relever cet enjeu par des actions de recherche concert\u00e9es et int\u00e9gr\u00e9es, allant du laboratoire au chevet du patient. Ainsi, des mod\u00e8les de criblage innovants seront partag\u00e9s pour enrichir la liste de compos\u00e9s potentiellement synergiques et diff\u00e9rentes combinaisons seront \u00e9valu\u00e9es \u00e0 l\u2019aide de mod\u00e8les d’infection ex vivo<\/em> et in vivo<\/em> afin d’identifier des sch\u00e9mas multidimensionnels optimis\u00e9s. En parall\u00e8le, Mustart identifiera des biomarqueurs traduisant l\u2019\u00e9volution du traitement en temps r\u00e9el, chez la souris et chez les patients. Ces marqueurs, destin\u00e9s \u00e0 pr\u00e9dire les rechutes et l\u2019apparition de r\u00e9sistances, permettront de personnaliser les traitements de mani\u00e8re rationnelle et en temps r\u00e9el, ainsi que de diminuer les co\u00fbts des essais cliniques de phase II.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n NAILR <\/span>\r\n\r\n \r\n Novel Anti-Infectives with Limited Resistance <\/span>\r\n\r\n \r\n Nouveaux anti-infectieux \u00e0 r\u00e9sistance limit\u00e9e <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Vincent Cattoir <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Universit\u00e9 de Rennes 1 UR1 EPSCP <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

Inserm – D\u00e9l\u00e9gation r\u00e9gionale Paris 07 ;
\nInstitut Pasteur de Paris ;
\nInserm – D\u00e9l\u00e9gation Auvergne Rh\u00f4ne Alpes ;
\nSorbonne Universit\u00e9 ;
\nAnses<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 4) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 60 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

En r\u00e9ponse au besoin urgent de d\u00e9velopper de nouveaux agents th\u00e9rapeutiques, le projet NAILR se fonde sur la caract\u00e9risation de quatre compos\u00e9s d\u2019une nouvelle famille de peptidomim\u00e9tiques anti-infectieux (heptapseudopeptides) produits par une toxine bact\u00e9rienne. Le consortium r\u00e9unit sept partenaires aux comp\u00e9tences compl\u00e9mentaires sur des disciplines vari\u00e9es\u00a0: microbiologistes cliniques et mol\u00e9culaires, biochimistes, structuralistes, v\u00e9t\u00e9rinaires, cliniciens, pharmacologues, \u00e9cologistes et experts pour le microbiome intestinal. Le projet s\u2019articule autour de six enjeux dont le spectre complet de l\u2019activit\u00e9 antimicrobienne de ces nouveaux m\u00e9dicaments anti-infectieux, leurs activit\u00e9s bact\u00e9ricides\/bact\u00e9riostatiques, leur synergie\/antagonisme avec les antibiotiques existants, leurs m\u00e9canismes d’action et leur(s) cible(s) mol\u00e9culaire(s) dans diff\u00e9rents milieux bact\u00e9riens (Enterococcus faecium<\/em>, Staphylococcus aureus<\/em>, Escherichia coli<\/em> et Pseudomonas aeruginosa<\/em>), leurs m\u00e9canismes de r\u00e9sistance et les co\u00fbts d’adaptation de la r\u00e9sistance, leurs param\u00e8tres PK\/PD et leur efficacit\u00e9 sur diff\u00e9rents mod\u00e8les animaux d\u2019infections. En outre, l\u2019impact de ces peptides sur le microbiote intestinal et sur le m\u00e9tabolome humain sera \u00e9tudi\u00e9, ainsi que leur stabilit\u00e9 dans l’environnement (eau, sol, s\u00e9diments), et leur impact sur les communaut\u00e9s microbiennes environnementales.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n NASPEC <\/span>\r\n\r\n \r\n Narrow spectrum antibiotics to fight the emergence of bacterial resistance <\/span>\r\n\r\n \r\n Antibiotiques \u00e0 spectre \u00e9troit pour lutter contre l\u2019\u00e9mergence de la r\u00e9sistance bact\u00e9rienne <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Michel Arthur <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Universit\u00e9 de Paris UP EPSCP <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

CNRS – D\u00e9l\u00e9gation r\u00e9gionale \u00cele-de-France Gif-sur-Yvette ;
\nInstitut Pasteur ;
\nCNRS – D\u00e9l\u00e9gation r\u00e9gionale Alpes ;
\nCNRS – D\u00e9l\u00e9gation Paris-Centre<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 4) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 60 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Le projet NASPEC vise \u00e0 d\u00e9velopper des antibiotiques ciblant les bact\u00e9ries \u00e0 Gram n\u00e9gatif multi-r\u00e9sistantes, tout en r\u00e9duisant les dommages collat\u00e9raux de l’antibioth\u00e9rapie sur la flore commensale. Afin d’obtenir une activit\u00e9 s\u00e9lective sur les agents pathog\u00e8nes, deux antibiotiques de la famille des b\u00eata-lactamines seront combin\u00e9s au sein d’une m\u00eame mol\u00e9cule pour obtenir des pro-m\u00e9dicaments inactifs. L\u2019hydrolyse de la premi\u00e8re b\u00eata-lactamine par la b\u00eata-lactamase produite par la bact\u00e9rie responsable de l\u2019infection lib\u00e9rera la deuxi\u00e8me b\u00eata-lactamine sous une forme active. Le consortium NASPEC r\u00e9unit\u00a0: i) deux \u00e9quipes de chimie qui \u00e9tudieront les b\u00eata-lactames existants et leurs voies de synth\u00e8se pour concevoir des pro-m\u00e9dicaments appropri\u00e9s en introduisant des liens clivables\u00a0; ii)\u00a0une \u00e9quipe de biochimie qui \u00e9valuera les compos\u00e9s synth\u00e9tiques pour leur activit\u00e9 antibact\u00e9rienne, leur mode d\u2019action et leur sp\u00e9cificit\u00e9 pour les bact\u00e9ries productrices de b\u00eata-lactamases\u00a0; iii) trois \u00e9quipes de biologie structurale sp\u00e9cialis\u00e9es dans la cristallographie et l\u2019analyse par RMN des b\u00eata-lactamases et des transpeptidases, ainsi qu\u2019une \u00e9quipe sp\u00e9cialis\u00e9e dans la mod\u00e9lisation des interactions entre m\u00e9dicaments et cibles, qui contribueront \u00e0 la conception des mol\u00e9cules. Les b\u00eata-lactamines existantes et celles synth\u00e9tis\u00e9es seront test\u00e9es sur le microbiote en utilisant des mod\u00e8les de souris colonis\u00e9es par une flore humaine. L\u2019impact potentiel de ces mol\u00e9cules sera recherch\u00e9 par analyse m\u00e9tag\u00e9nomique associ\u00e9e \u00e0 la d\u00e9tection de fragments de peptidoglycane par les r\u00e9cepteurs NOD. Les r\u00e9sultats de ce projet garantiront un pipeline<\/em> rationnel pour la mise au point de nouvelles mol\u00e9cules th\u00e9rapeutiques qui feront l\u2019objet d\u2019un d\u00e9veloppement pr\u00e9clinique avec un partenaire industriel \u00e0 la fin du projet.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n OrA-NEAT <\/span>\r\n\r\n \r\n Development and evaluation of a tailored antibiotic stewardship program in nursing homes based on an in-depth qualitative assessment of organizations, health professionals\u2019 attitudes, and needs <\/span>\r\n\r\n \r\n D\u00e9veloppement et \u00e9valuation d\u2019un programme personnalis\u00e9 de bon usage des antibiotiques adapt\u00e9 aux besoins des EHPAD fran\u00e7ais <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Nelly Agrinier <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Universit\u00e9 de Lorraine -APEMAC EPSCP <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

CHRU Nancy, Inserm, Universit\u00e9 de Lorraine, CIC, \u00c9pid\u00e9miologie clinique, Nancy ;
\nSciences Po, Centre de sociologie des organisations (CSO), CNRS, Paris ;
\nCentre de recherche Inserm-Universit\u00e9 de Bordeaux U1219 Bordeaux population health – M\u00e9dicament et sant\u00e9 des populations ;
\nCHU de Nantes, CPIAS Pays-de-Loire<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 2) <\/span><\/strong>\r\n , 3) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 72 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

\u00c0 partir d\u2019un pr\u00e9c\u00e9dent d\u00e9veloppement par l\u2019\u00e9quipe d\u2019une approche interdisciplinaire de la recherche interventionnelle, le projet OrA-NEAT propose un nouveau cadre m\u00e9thodologique pour l\u2019\u00e9laboration et l\u2019\u00e9valuation de programmes de bon usage des antibiotiques ou \u00ab\u00a0antimicrobial stewardship<\/em>\u00a0\u00bb (AMS) comprenant quatre \u00e9l\u00e9ments cl\u00e9s\u00a0<\/strong>: (i) \u00c9laboration d’un cadre conceptuel du contexte socioculturel qui sous-tend l\u2019utilisation de l’antibiotique\u00a0; (ii) D\u00e9veloppement d’un outil de diagnostic contextuel sur l\u2019AMS\u00a0; (iii) D\u00e9veloppement d\u2019outils AMS et d\u2019un support de mise en \u0153uvre adapt\u00e9 au contexte d’int\u00e9r\u00eat\u00a0; (iv) \u00c9valuation du programme AMS r\u00e9sultant. Le projet pr\u00e9voit d\u2019appliquer ensuite ce cadre m\u00e9thodologique \u00e0 un contexte sanitaire sp\u00e9cifique, particuli\u00e8rement enclin \u00e0 la r\u00e9sistance aux antimicrobiens, celui des EHPAD. Le projet OrA-NEAT vise \u00e0\u00a0: (i) Comprendre les comportements des professionnels de la sant\u00e9 qui conduisent \u00e0 l\u2019utilisation des antibiotiques et leurs attitudes vis-\u00e0-vis de l\u2019AMS dans les EHPAD fran\u00e7ais afin d\u2019identifier les opportunit\u00e9s d\u2019AMS\u00a0; (ii)\u00a0D\u00e9velopper un programme d\u2019AMS \u00e0 multiples facettes adaptable aux attitudes des professionnels de la sant\u00e9 vis-\u00e0-vis de l\u2019AMS et adapt\u00e9 aux contextes des EHPAD\u00a0; (iii) \u00c9valuer l\u2019efficacit\u00e9, la durabilit\u00e9, la mise en \u0153uvre et la transf\u00e9rabilit\u00e9 d\u2019un tel programme dans les EHPAD. OrA-NEAT s\u2019appuie sur une approche interdisciplinaire innovante qui fournira un cadre m\u00e9thodologique adapt\u00e9 au d\u00e9veloppement et \u00e0 l\u2019\u00e9valuation de programmes d\u2019AMS dans d\u2019autres contextes, par exemple en milieu ambulatoire voire en m\u00e9decine animale.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n PHAG-ONE <\/span>\r\n\r\n \r\n Development, production and clinical use of therapeutic phages to treat infections due to antibiotic resistant bacteria <\/span>\r\n\r\n \r\n D\u00e9veloppement, production et utilisation en clinique de phages th\u00e9rapeutiques pour traiter les infections dues aux bact\u00e9ries r\u00e9sistantes aux antibiotiques <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Fr\u00e9d\u00e9ric Laurent <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Hospices civils de Lyon HCL Autre CHU <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

Universit\u00e9 Claude-Bernard Lyon 1 ;
\nCentre international de recherche en infectiologie, Inserm U1111, D\u00e9l\u00e9gation r\u00e9gionale Lyon ;
\nUMR CNRS 5558 CNRS, Villeurbanne ;
\nCEA LETI Grenoble ;
\nUniversit\u00e9 de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ;
\nUniversit\u00e9 de Bordeaux, Sciences Po<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 3) <\/span><\/strong>\r\n , 4) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 72 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Le projet PHAG-ONE rassemble un consortium d\u2019expertises microbiologiques, technologiques, pharmaceutiques, pharmacologiques et cliniques d’\u00e9quipes poss\u00e9dant une expertise dans la phagoth\u00e9rapie ainsi que dans l\u2019\u00e9valuation et\/ou la production de th\u00e9rapeutiques innovantes. Les trois esp\u00e8ces cibles (Staphylococcus<\/em> aureus, Staphylococcus epidermidis et Escherichia coli<\/em>) ont \u00e9t\u00e9 s\u00e9lectionn\u00e9s pour le d\u00e9veloppement de phages \u00e0 usage th\u00e9rapeutique en clinique humaine et pour mettre en place des essais cliniques. Au-del\u00e0 de l\u2019innovation scientifique, ce projet vise \u00e0 \u00e9tablir les bases de la premi\u00e8re plateforme fran\u00e7aise d\u2019isolement, de caract\u00e9risation, de purification, de production et d\u2019application clinique de th\u00e9rapies par les phages. Le projet comprend 9 axes allant de la constitution d\u2019une collection de bact\u00e9riophages lytiques pour les 3 esp\u00e8ces cibles en passant par les \u00e9tapes d\u2019optimisation\/validation des protocoles de production et des proc\u00e9d\u00e9s de purification des phages, les \u00e9tudes d\u2019efficacit\u00e9 et de PK\/PD in vitro<\/em> et in vivo<\/em> dans des mod\u00e8les animaux jusqu\u2019\u00e0 la mise en place et le suivi de cohortes d\u2019utilisation compassionnelle de ces phages et enfin la r\u00e9daction d\u2019un essai clinique. Le d\u00e9veloppement d\u2019outils innovants d’imagerie pour le titrage des phages ainsi que pour la r\u00e9alisation de phagogrammes standardis\u00e9s automatis\u00e9s et rapides fait aussi partie des objectifs. Enfin, de fa\u00e7on concomitante, une analyse socio-anthropologique de la production de connaissance entourant l\u2019\u00e9mergence de cette innovation biom\u00e9dicale ainsi que de son environnement r\u00e9glementaire et institutionnel sera conduite.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n Seq2Diag <\/span>\r\n\r\n \r\n Whole genome sequencing and artificial intelligence to characterize and diagnose antibiotic resistance and capacity to escape treatment <\/span>\r\n\r\n \r\n S\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome entier et intelligence artificielle pour caract\u00e9riser et diagnostiquer la r\u00e9sistance aux antibiotiques et la capacit\u00e9 d\u2019\u00e9chapper au traitement <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Philippe Glaser <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Institut Pasteur IP Autre Fondation de recherche <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

Laboratoire de recherche en informatique, Universit\u00e9 Paris-Saclay ;
\nInserm – D\u00e9l\u00e9gation r\u00e9gionale Nouvelle Aquitaine ;
\nCNRS – D\u00e9l\u00e9gation Ile-de-France Gif-sur-Yvette (DR4) ;
\nInserm – D\u00e9l\u00e9gation r\u00e9gionale Paris 11 ;
\nAnses – Lyon ;
\nUniversite de Franche-Comt\u00e9<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 2) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 60 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Avec l\u2019objectif de d\u00e9velopper des tests in silico<\/em> de sensibilit\u00e9 aux antibiotiques, le projet Seq2Diag s\u2019appuie sur un consortium de laboratoires ayant une expertise dans les domaines de la r\u00e9sistance aux antibiotiques, du diagnostic et de la microbiologie clinique chez l\u2019humain et l\u2019animal, de la g\u00e9nomique bact\u00e9rienne, de l\u2019\u00e9volution, de l\u2019automatisation, de la bioinformatique, de la mod\u00e9lisation et de l\u2019intelligence artificielle (IA). Trois esp\u00e8ces \u00e0 Gram n\u00e9gatif souvent multir\u00e9sistantes ont \u00e9t\u00e9 s\u00e9lectionn\u00e9es : Escherichia coli<\/em>, Klebsiella pneumoniae<\/em> et Pseudomonas aeruginosa<\/em>. Le projet vise \u00e0 \u00e9tablir des bases de donn\u00e9es g\u00e9nomiques et ph\u00e9notypiques \u00e0 partir de collections de souches cliniques afin de mieux analyser la relation g\u00e9notype-ph\u00e9notype, \u00e0 d\u00e9terminer l\u2019impact de la pression antibiotique sur l\u2019\u00e9volution des isolats en milieu hospitalier et les causes d\u2019\u00e9chec des traitements. Des m\u00e9thodes de ph\u00e9notypage avanc\u00e9es seront d\u00e9velopp\u00e9es pour analyser la r\u00e9ponse aux antibiotiques et aux combinaisons d\u2019antibiotiques, pour quantifier la persistance, la tol\u00e9rance et les param\u00e8tres pharmacodynamiques qui contribuent \u00e0 l\u2019\u00e9chec du traitement. \u00e0 partir des donn\u00e9es acquises, des m\u00e9thodes d\u2019apprentissage seront d\u00e9ploy\u00e9es pour pr\u00e9dire les ph\u00e9notypes et caract\u00e9riser les g\u00e8nes et leurs mutations sous-jacents. Une preuve de concept pour l’utilisation des tests de sensibilit\u00e9 aux antibiotiques in silico<\/em> dans les laboratoires de microbiologie clinique sera r\u00e9alis\u00e9e pour des infections d\u2019\u00e9tiologies diverses. \u00e0 terme, ce projet concourra \u00e0 d\u00e9velopper l\u2019utilisation du s\u00e9quen\u00e7age g\u00e9nomique dans le diagnostic bact\u00e9riologique et \u00e0 caract\u00e9riser de nouveaux m\u00e9canismes contribuant \u00e0 la r\u00e9sistance aux antibiotiques et \u00e0 l\u2019\u00e9chappement au traitement.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n \r\n

\r\n \r\n TheraEPI <\/span>\r\n\r\n \r\n Epigenetic-based Therapy to bypass resistance <\/span>\r\n\r\n \r\n Th\u00e9rapies \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques pour esquiver la r\u00e9sistance <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Paola B. Arimondo <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n Institut Pasteur IP Autre Fondation de recherche <\/span>\r\n <\/td>\r\n \r\n \r\n

INRAE Jouy-en-Josas – labo Micalis. \u00c9quipe \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique et microbiologie cellulaire ;
\nUniversit\u00e9 de Paris – \u00c9pig\u00e9n\u00e9tique et destin cellulaire ;
\nCNRS<\/p>\n <\/span>\r\n <\/td>\r\n\r\n <\/tr>\r\n\r\n

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\r\n \r\n Challenge: 4) <\/span><\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n Duration: 60 mois<\/strong>\r\n <\/span>\r\n\r\n \r\n

Au cours de l\u2019infection, nombreux pathog\u00e8nes ciblent la chromatine de l\u2019h\u00f4te ou sa machinerie \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique, alt\u00e9rant son \u00e9pig\u00e9nome et la r\u00e9ponse immunitaire. TheraEPI ambitionne d\u2019inhiber chimiquement les modifications \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques produites par les bact\u00e9ries, dans le but de contrecarrer les avantages de la bact\u00e9rie, renforcer les d\u00e9fenses de l\u2019h\u00f4te et de minimiser l\u2019\u00e9mergence de la r\u00e9sistance bact\u00e9rienne. Le projet combine une panoplie de comp\u00e9tences en biologie et \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique des infections, en prot\u00e9omique, en chimio-informatique et en chimie m\u00e9dicinale, dans la conception de m\u00e9dicaments. Sept agents pathog\u00e8nes \u2013\u00a0<\/strong>des genres Chlamydia<\/em>, Legionella<\/em>, Listeria<\/em>, Pseudomonas<\/em>, Staphylococcus<\/em>, Streptococcus<\/em> et Theileria<\/em>\u00a0\u2013<\/strong> retenus comme mod\u00e8les d\u2019infection seront utilis\u00e9s pour cribler des chimioth\u00e8ques sp\u00e9cifique et originaux ciblant les m\u00e9thyltransf\u00e9rases d\u2019histones ou les prot\u00e9ines qui reconnaissent les histones m\u00e9thyl\u00e9s, afin d\u2019identifier les compos\u00e9s chimiques qui inhibent la croissance microbienne et\/ou r\u00e9duisent la r\u00e9pression de la r\u00e9ponse immunitaire de l\u2019h\u00f4te. Les meilleurs candidats m\u00e9dicaments seront optimis\u00e9s en termes d\u2019efficacit\u00e9, de s\u00e9lectivit\u00e9 et de propri\u00e9t\u00e9s pharmacologiques par chimie m\u00e9dicinale. Les cibles des compos\u00e9s actifs seront identifi\u00e9es en utilisant de nouvelles approches de prot\u00e9omique. L\u2019activit\u00e9 des compos\u00e9s sera \u00e9valu\u00e9e dans des mod\u00e8les infectieux complexes, notamment dans des cellules humaines primaires et chez la souris pour obtenir la preuve de concept de leur potentiel comme nouveaux agent antibiotiques. Cette approche innovante devrait contribuer \u00e0 traiter les infections sans s\u00e9lection de r\u00e9sistance.<\/p>\n <\/span>\r\n <\/div>\r\n <\/td>\r\n <\/tr>\r\n <\/tbody>\r\n<\/table>\r\n\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

11 projects were selected from around 70 submissions (i.e. a success rate of almost 16%), and received grants of between \u20ac1 and \u20ac3 million. Each project addresses one or more of the 4 challenges defined below. 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