L’ingénieur.e d’étude aura pour mission de traiter et analyser des échantillons de selles collectés dans le cadre d’une vaste cohorte de suivi de volontaires sains. Le but de cette étude est de mieux comprendre la dynamique de la colonisation par les bactéries Escherichia coli et l’adaptation de cette espèce à son environnement.
Dans ce cadre, il/elle sera amené.e à travailler à l’organisation et au développement de la cohorte, au technicage et stockage des échantillons, à la gestion des collections.
Il/elle conduira des techniques de base de microbiologie et des techniques de biologie moléculaire (génotypage, séquençage haut débit) pour caractériser la diversité intra-hôte d’E. coli et ses changements au cours du temps.
Activités principales
- Développement, organisation et suivi d’une cohorte de suivi longitudinal de volontaires sains avec prélèvements de selles.
- Technicage d’échantillons de selles (aliquotage, stockage).
- Gérer la base de données et banque d’échantillons.
- Conduire les techniques de base de microbiologie (isolement, identification, antibiogrammes, etc…).
- Définir, adapter et conduire les techniques de biologie moléculaire pour caractériser les souches d’E. coli présentes dans les selles : génotypage, séquençage haut débit.
- Préparation de banque, séquençage haut débit, etc.
- Effectuer des analyses de bioinformatique standard sur les reads séquencés.
Activités associées
- Rédiger et présenter des rapports d’activité
- Exploiter et présenter les résultats des analyses
- Gérer les moyens financiers associés au projet
- Assurer la gestion des stocks et des commandes
- Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations orales et de publications
- Participer à l’organisation et à la vie collective de l’équipe
Connaissances
- Formation forte en microbiologie et biologie moléculaire
- Connaissance en gestion de jeux de données
Savoir-faire
- Bon niveau en bactériologie et en biologie moléculaire
Aptitudes
- Rigueur, sens de l’organisation et esprit d’initiative.
- Bonne communication
- Capacités organisationnelles solides
- Capacité à travailler en équipe
Spécificité(s) / Contrainte(s) du poste
Expérience
- Au moins un stage ou une expérience en bactériologie.
- Expérience professionnelle souhaitée d’au moins 2 ans serait appréciée.
Diplôme(s)
Master, Ecole d’ingénieur en biotechnologies, BTS plus licence professionnelle avec 2 ans d’expérience souhaités.
Structure d’accueil
Code unité : UMR_S1137
Intitulé : IAME
Responsable : Erick DENAMUR
Composition : 4 équipes
Adresse : Faculté de médecine Paris-Diderot – Site Bichat, 16 rue Henri Huchard, 75018 Paris
Délégation régionale : Paris IDF-Centre Nord
Contrat : CDD
Durée : 18 mois renouvelables
Rémunération : Entre 2100 et 2300 euros bruts mensuels selon expérience.
Date souhaitée de prise de fonctions : dès que possible (février ou mars 2022)
Informations Générales
Temps de Travail : Temps Plein, 38h30
32 jours de congés + 13 jours de RTT.
Activités télétravaillables
1 jour/semaine maximum à compter de 6 mois d’exercice sur les fonctions et sur accord du responsable hiérarchique.
Pour en savoir plus
Sur l’Inserm : https://www.inserm.fr/
Site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx
Sur la politique handicap de l’Inserm et sur la mise en place d’aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap : emploi.handicap@inserm.fr.
Pour Postuler
Adresser votre CV et lettre de motivation avant le 24 décembre 2021 à :
